巻駅の住みやすさ！治安・家賃相場・クチコミ(新潟県)

相対式ホーム2面2線を有する地上駅。互いのホームは跨線橋で連絡している。日本の鉄道駅直営駅・社員配置駅である。駅舎内の改札口には自動改札機が3通路設置され、全通路でSuicaが利用できる。駅舎内には有人改札を兼ねるみどりの窓口（営業時間 7:00 - 20:00）、自動券売機（2台）のほか、待合室、自動販売機などがある。トイレは改札内外に1か所ずつ設置されている。以前、待合室内には売店（キヨスク）があったがすでに閉店した。現在新潟市、燕市などの沿線自治体は東日本旅客鉄道新潟支社・JR東日本新潟支社に対し、当駅を含む吉田 - 内野間の昼間時間帯の運行間隔を、内野 - 新潟間と同じ20分間隔に短縮するよう求めている（詳細は越後線現状を参照）。